Se for possível, é bom dar uma ligada pelo menos de 15 em 15 dias, deixar funcionar até atingir a temperatura, calibrar os pneus... etc.
caso tenha que deixar totalmente parada, é bom deixar o minimo de combustível possível, desconectar os cabos da bateria, pode deixa no freio de mão, ou só engatada (se não houver risco dela se mover), verificar se todos os óleos estão em ordem, tampar a entrada de ar do filtro (animais adoram esses lugares), deixar o fluido do radiador com o aditivo correto (água pura vai oxidar tudo).
e na hora de ligar, deverá esgotar o diesel que sobrou e colocar novo, trocar os óleos (já estarão vencido) e talvez fluido de freio (absorve bastante água do ar pelo respiro, isso vale para carros em funcionamento tbm), ligar a bateria.
acho que isso vai minimizar bastante os problemas.